Menjadi lembaga pendidikan pencetak para ahli ilmu yang mampu menggabungkan nash (teks) syariat dan rasional dengan pemahaman wasathi (moderat) yang mempertimbangkan aspek orisinilitas dan kemodernan, menjadi pengayom di tengah masyarakat dengan semangat berkhidmah kepada Umat dan memajukan peradaban, dan menjadi rujukan ilmu-ilmu keislaman, serta menjadi tempat ibadah yang aktif menebar manfaat
1. Mempersiapkan para santri yang hafal al-Qur`an dengan hafalan yang itqan dan mahir dalam memahami kitab kuning dengan kurikulum khas Pesantren Nurul Azhar Kalimantan, serta memprioritaskan transmisi sanad dan ijazah sanad ilmu-ilmu keislaman.
2. Membentuk santri yang memiliki lifeskill, mandiri, dan terampil dalam berkhidmah kepada masyarakat, bangsa, dan negara.
3. Menjadikan Pesantren sebagai pusat kajian yang aktif mengkaji turats (kitab klasik), melakukan mudzakarah (diskusi ilmiyah), dan menjawab persoalan-persoalan yang menjadi dinamika masyarakat, serta mendakwahkan pemahaman Ahlussunnah wal Jama`ah al Asy`ariyah, Mazhab Syafi`i, dan pengamalan Tasawuf
4. Menjadikan pesantren sebagai mitra masyarakat dalam penguatan akidah dan pedoman dalam melakukan amaliyah yang sahih
Menjadi lembaga pendidikan pencetak para ahli ilmu yang mampu menggabungkan nash (teks) syariat dan rasional dengan pemahaman wasathi (moderat) yang mempertimbangkan aspek orisinilitas dan kemodernan, menjadi pengayom di tengah masyarakat dengan semangat berkhidmah kepada Umat dan memajukan peradaban, dan menjadi rujukan ilmu-ilmu keislaman, serta menjadi tempat ibadah yang aktif menebar manfaat